（1）根據(jù)上述資料指出該房地產(chǎn)開發(fā)公司辦稅人員自行計算的土地增值稅稅額是否正確？如不正確，應如何進行調整？

該公司計算的土地增值稅稅額不正確。
①要根據(jù)配比原則計算當期可扣除的項目金額；
②房地產(chǎn)開發(fā)公司在工程竣工驗收后，根據(jù)合同約定，扣留建筑安裝施工企業(yè)一定比例的工程款，作為開發(fā)項目的質量保證金，在計算土地增值稅時，建筑安裝施工企業(yè)就質量保證金對房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)開具發(fā)票的，按發(fā)票所載金額予以扣除；未開具發(fā)票的，扣留的質量保證金不得計算扣除；
③納稅人能夠按轉讓房地產(chǎn)項目計算分攤利息支出，并能提供金融機構的貸款證明的，其允許扣除的房地產(chǎn)開發(fā)費用為：利息+（取得土地使用權支付的金額+房地產(chǎn)開發(fā)成本）×5%以內，對于超過貸款期限的加罰的利息不允許扣除；
④房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)中的一般納稅人銷售自行開發(fā)的房地產(chǎn)項目，適用一般計稅方法計稅，按照取得的全部價款和價外費用，扣除當期銷售房地產(chǎn)項目對應的土地價款后的余額計算銷售額；
⑤對從事房地產(chǎn)開發(fā)的納稅人允許按取得土地使用權時所支付的金額和房地產(chǎn)開發(fā)成本之和，加計20%扣除；
⑥計入土地增值稅的收入為不含增值稅的收入。
正確計算方法如下：
可扣除的取得土地使用權支付的金額=3500×（1+3%）×70%=2523.5（萬元）
可扣除的房地產(chǎn)開發(fā)成本=1500×（1-5%）×70%=997.5（萬元）
可扣除的房地產(chǎn)開發(fā)費用=80×70%+（2523.5+997.5）×4%=196.84（萬元）
與轉讓房地產(chǎn)有關的稅金=（9800-3500×70%）/（1+10%）×10%×（7%+3%+2%）=80.18（萬元）
可扣除項目金額合計=2523.5+997.5+196.84+80.18+（2523.5+997.5）×20%=4502.22（萬元）
增值額=9800-（9800-3500×70%）/（1+10%）×10%-4502.22=4629.60（萬元）
增值率=4629.60/4502.22×100%=102.83%
應繳納土地增值稅=4629.60×50%-4502.22×15%=1639.47（萬元）
該公司已繳納土地增值稅1484.64萬元，應補繳土地增值稅=1639.47-1484.64=154.83（萬元）。
該公司應做如下調賬分錄：
借：稅金及附加　　　　　　　　　　　　　　　　　　154.83
　貸：應交稅費——應交土地增值稅　　　　　　　　　　154.83
借：應交稅費——應交土地增值稅　　　　　　　　　　154.83
　貸：銀行存款　　　　　　　　　　　　　　　　　　　154.83

（2）計算該公司2018年出租寫字樓期間應繳納的城鎮(zhèn)土地使用稅和簽訂的租賃合同應繳納的印花稅。

出租寫字樓占地=20000×30%=6000（平方米），應繳納的城鎮(zhèn)土地使用稅=6000×4×4÷12=8000（元）；
當年簽訂房屋租賃合同應繳納的印花稅=120×3×1‰=0.36（萬元）。